Dieta jest głównym czynnikiem środowiskowym wpływającym na różnorodność i funkcjonalność mikroflory jelitowej, co może mieć znaczenie dla osób stosujących różne terapie dietetyczne. Celiakia to enteropatia spowodowana nieprawidłową odpowiedzią immunologiczną na białka glutenu zbożowego, a jedyną terapią jest przestrzeganie diety bezglutenowej. Ten model żywienia stosuje się również w nieceliakalnej nietolerancji na gluten, ale jest to jedynie dieta stosowana przejściowo.

Tymczasem wiele osób eliminuje gluten z diety pod wpływem pewnego rodzaju mody dietetycznej. Niestety może to mieć negatywne konsekwencje dla zdrowia. Dieta bezglutenowa może modyfikować skład i właściwości odpornościowe mikroflory jelitowej. Analizy mikrobioty kałowej i spożycia pokarmu wykazują, że ​​liczba zdrowych bakterii jelitowych (Bifidobacterium, Clostridium lituseburense i Faecalibacterium prausnitzii ) zmniejszyła się, podczas gdy liczba niezdrowych bakterii (Enterobacteriaceae i Escherichia coli ) wzrosła równolegle ze zmniejszeniem spożycia polisacharydów po zastosowaniu diety bezglutenowej. Próbki kału od pacjentów pod GFD, które reprezentują zmienioną mikrobiotę, również wywierały mniejszy wpływ stymulujący układ odpornościowy na jednojądrzaste komórki krwi obwodowej niż te pochodzące od osób na regularnej diecie zawierającej gluten.

Istotną rolę w budowaniu odpowiedniej flory jelitowej odgrywają również odpowiednia podaż witamin, błonnika i mikroskładników. Badania pokazują, że osoby rezygnujące ze spożywania glutenu, zdecydowanie częściej cierpią na niedobory wielu ważnych składników pokarmowych, m.in. takich jak:  błonnik pokarmowy,  witamina B12,  foliany,  żelazo, cynk,  magnez,  wapń.

Kobiety bez Diety: Katarzyna Błażejewska Stuhr, Daria Gradziuk, Marta Kielak, Elżbieta Lange, Hanna Stolińska, Agata Ziemnicka i Jagoda Fabicka, Kasia Rada z Czytaj Skład.